2018年7月國際一線醫學雜志公布了使用糞菌移植治療難治性潰瘍性腸炎的隨機雙盲對照實驗(信任度最高的臨床試驗方法)結果。雖然這幾年解析了腸內細菌和疾病的關系，但是感覺目前的治療方法還是比較野蠻和原始的。糞菌移植是否可以作為根治疾病的方法，還有待商權。

至今關于糞菌移植的文獻都停留在病例研究和評論中，而這次Gastroenterology雜志(美國消化病醫學會AGA)公布的RCT臨床試驗結果首次揭示了糞菌移植的治療情況。

此次實驗對象為18~60歲的潰瘍性腸炎患者，共75人，將患者分為兩組：移植組的38人接受經肛門糞菌移植，37人作為安慰機組每周只接受一次水灌腸，持續6周。移植組的糞菌有6位提供者，在排泄后5小時內收集或冷凍保存糞便50g，使用時用300ml飲用水稀釋溶解后移植。

在糞菌移植前、后各用腸鏡檢查，用Mayo score標準評估腸炎情況。結果顯示，移植組9人(24%)、安慰劑組2人(5%)腸炎得到緩解，治療效果的統計有效。 緩解的9人中有8人維持了52周的緩解狀態，其中4人可以停止服用潰瘍性腸炎的藥物。

日本藤田醫科大學病院消化道內科主任大宮直木認為“糞菌移植與除菌治療結合后治療效果可能更佳。”

日本就醫網為IBD(炎癥性腸病)的患者開通藤田醫科大學病院的綠色就診通道，遠程視頻問診和專家門診為國內患者提供一站式服務。